MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004556	AT	3	6	13	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004556	GCT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004556	CAT	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004556	TGA	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004556	CCA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197946
6	NC_004556	TAG	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
7	NC_004556	AGT	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
8	NC_004556	ACA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
9	NC_004556	TAC	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197946
10	NC_004556	AC	4	8	456	463	50 %	0 %	0 %	50 %	28197946
11	NC_004556	TTG	2	6	480	485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197946
12	NC_004556	CTCG	2	8	503	510	0 %	25 %	25 %	50 %	28197946
13	NC_004556	TGC	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197946
14	NC_004556	TGG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197946
15	NC_004556	TGC	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197946
16	NC_004556	TTCG	2	8	663	670	0 %	50 %	25 %	25 %	28197946
17	NC_004556	ATTG	2	8	757	764	25 %	50 %	25 %	0 %	28197946
18	NC_004556	T	6	6	776	781	0 %	100 %	0 %	0 %	28197946
19	NC_004556	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197946
20	NC_004556	ATT	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197946
21	NC_004556	CGAT	2	8	939	946	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
22	NC_004556	CCT	2	6	947	952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197946
23	NC_004556	A	8	8	1039	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	28197946
24	NC_004556	TAG	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
25	NC_004556	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
26	NC_004556	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197946
27	NC_004556	CTGA	2	8	1310	1317	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
28	NC_004556	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
29	NC_004556	C	6	6	1468	1473	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_004556	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_004556	AAAT	2	8	1508	1515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004556	A	6	6	1537	1542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004556	ACA	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004556	A	8	8	1677	1684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004556	ACC	4	12	1690	1701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_004556	GTA	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
37	NC_004556	TAA	2	6	1847	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28197947
38	NC_004556	GAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
39	NC_004556	CAAAAA	2	12	1910	1921	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	28197947
40	NC_004556	GAT	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
41	NC_004556	TAT	3	9	2124	2132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
42	NC_004556	TTA	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
43	NC_004556	CAA	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197947
44	NC_004556	TTA	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
45	NC_004556	TG	3	6	2279	2284	0 %	50 %	50 %	0 %	28197947
46	NC_004556	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
47	NC_004556	TTA	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
48	NC_004556	ATTG	2	8	2451	2458	25 %	50 %	25 %	0 %	28197947
49	NC_004556	GGC	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197947
50	NC_004556	GTG	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197947
51	NC_004556	AAG	3	9	2642	2650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197947
52	NC_004556	GAA	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197947
53	NC_004556	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
54	NC_004556	GTG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197947
55	NC_004556	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197947
56	NC_004556	AGT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
57	NC_004556	ATA	2	6	2864	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004556	ATA	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004556	T	7	7	2895	2901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004556	ATTTA	2	10	2920	2929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004556	TAA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004556	TAA	2	6	2992	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004556	TTTA	2	8	2998	3005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004556	TGT	2	6	3028	3033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004556	T	6	6	3036	3041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004556	ATG	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004556	TTA	2	6	3074	3079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004556	T	6	6	3080	3085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004556	TCA	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004556	TTC	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004556	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197948
72	NC_004556	TTTC	2	8	3206	3213	0 %	75 %	0 %	25 %	28197948
73	NC_004556	T	6	6	3230	3235	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
74	NC_004556	TAAT	2	8	3388	3395	50 %	50 %	0 %	0 %	28197948
75	NC_004556	ACGTCG	2	12	3398	3409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28197948
76	NC_004556	AGT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197948
77	NC_004556	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197948
78	NC_004556	ACG	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197948
79	NC_004556	ATT	2	6	3578	3583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197948
80	NC_004556	AAC	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197948
81	NC_004556	AGAA	2	8	3661	3668	75 %	0 %	25 %	0 %	28197948
82	NC_004556	GA	3	6	3750	3755	50 %	0 %	50 %	0 %	28197948
83	NC_004556	AAC	2	6	3760	3765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197948
84	NC_004556	TTTTAA	2	12	3815	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197948
85	NC_004556	ATGG	2	8	3829	3836	25 %	25 %	50 %	0 %	28197948
86	NC_004556	CGT	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197948
87	NC_004556	TTGA	2	8	3855	3862	25 %	50 %	25 %	0 %	28197948
88	NC_004556	TTTA	2	8	3866	3873	25 %	75 %	0 %	0 %	28197948
89	NC_004556	T	6	6	3968	3973	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
90	NC_004556	CTA	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197948
91	NC_004556	T	6	6	4032	4037	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
92	NC_004556	T	6	6	4187	4192	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
93	NC_004556	ATT	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004556	TCT	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004556	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004556	AT	3	6	4472	4477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004556	T	6	6	4482	4487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004556	AGAA	2	8	4517	4524	75 %	0 %	25 %	0 %	28197949
99	NC_004556	GATA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	25 %	0 %	28197949
100	NC_004556	GCT	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
101	NC_004556	GGC	2	6	4779	4784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197950
102	NC_004556	AT	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	28197950
103	NC_004556	TAC	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
104	NC_004556	CAC	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197950
105	NC_004556	GTCT	2	8	4976	4983	0 %	50 %	25 %	25 %	28197950
106	NC_004556	AGA	2	6	5027	5032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197950
107	NC_004556	TGG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
108	NC_004556	CGA	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197950
109	NC_004556	TGG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
110	NC_004556	CAA	2	6	5199	5204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197950
111	NC_004556	TAC	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
112	NC_004556	TCCT	2	8	5355	5362	0 %	50 %	0 %	50 %	28197950
113	NC_004556	AGTT	2	8	5378	5385	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
114	NC_004556	TGAT	2	8	5386	5393	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
115	NC_004556	GTG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
116	NC_004556	GGT	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
117	NC_004556	TTG	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197950
118	NC_004556	TGC	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
119	NC_004556	TGC	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
120	NC_004556	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197950
121	NC_004556	TTC	2	6	5771	5776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197950
122	NC_004556	GGA	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197950
123	NC_004556	TGC	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
124	NC_004556	GCT	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
125	NC_004556	TCG	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
126	NC_004556	CTG	2	6	6055	6060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
127	NC_004556	A	6	6	6089	6094	100 %	0 %	0 %	0 %	28197950
128	NC_004556	CT	3	6	6159	6164	0 %	50 %	0 %	50 %	28197950
129	NC_004556	TCA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
130	NC_004556	T	7	7	6312	6318	0 %	100 %	0 %	0 %	28197950
131	NC_004556	ATTG	2	8	6335	6342	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
132	NC_004556	GCC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
133	NC_004556	GCC	2	6	6491	6496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
134	NC_004556	AT	3	6	6533	6538	50 %	50 %	0 %	0 %	28197950
135	NC_004556	CGC	2	6	6539	6544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
136	NC_004556	CCT	2	6	6587	6592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197950
137	NC_004556	TGA	2	6	6734	6739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197950
138	NC_004556	ACA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197950
139	NC_004556	GCC	2	6	6750	6755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
140	NC_004556	TTG	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197950
141	NC_004556	CAAT	2	8	6912	6919	50 %	25 %	0 %	25 %	28197950
142	NC_004556	GAA	2	6	6962	6967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197950
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148	NC_004556	TCA	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_004556	TAC	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197951
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165	NC_004556	TGA	2	6	8125	8130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197952
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265	NC_004556	CAC	2	6	12588	12593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197956
266	NC_004556	ATC	2	6	12616	12621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197956
267	NC_004556	CAAGGG	2	12	12631	12642	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	28197956
268	NC_004556	TAG	2	6	12699	12704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197957
269	NC_004556	CTC	2	6	12743	12748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197957
270	NC_004556	GATGT	2	10	12754	12763	20 %	40 %	40 %	0 %	28197957
271	NC_004556	TTA	2	6	12769	12774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197957
272	NC_004556	AG	3	6	12833	12838	50 %	0 %	50 %	0 %	28197957
273	NC_004556	CCG	3	9	12868	12876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197957
274	NC_004556	CAATT	2	10	12878	12887	40 %	40 %	0 %	20 %	28197957
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280	NC_004556	GCT	3	9	13054	13062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197957
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283	NC_004556	TAC	2	6	13120	13125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_004556	ATAC	2	8	13247	13254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_004556	GC	3	6	13272	13277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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294	NC_004556	CTT	2	6	13808	13813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_004556	TGG	2	6	13966	13971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197958
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388	NC_004556	CG	5	10	19161	19170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
389	NC_004556	CGC	2	6	19179	19184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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392	NC_004556	CCG	2	6	19324	19329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
393	NC_004556	CAT	2	6	19369	19374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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397	NC_004556	ATG	2	6	19458	19463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
398	NC_004556	TG	4	8	19462	19469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
399	NC_004556	TC	3	6	19476	19481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
400	NC_004556	TTG	2	6	19500	19505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_004556	GGCAAC	24	144	19506	19649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_004556	GTGG	2	8	19715	19722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
403	NC_004556	TGTGC	10	50	19779	19828	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_004556	CGT	2	6	19861	19866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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